吉木乃国际互市贸易区以口岸和县城北部为核心，沿“双城一体”“葡萄串”思路规划“口岸、县城‘双城一体’贸易区”。该贸易区总体目标：充分发挥吉木乃国际互市贸易区地跨中哈两国的区位优势，依托中国广阔市场，建立一个投资自由、贸易自由、人员出入自由、高度开放的综合性国际互市贸易，使吉木乃口岸成为“东联西出”的枢纽，成为新疆地区乃至中国的国际商品交易中心、物流中心、信息服务中心和面向哈、俄、蒙等国市场的国际化自由贸易区。

吉木乃互市贸易区建设主要共分口岸互贸、交易、信息、物流、仓储、配套服务等区，分三期建设。一期项目主要包括口岸互贸区（口岸管理区、互贸城、保税区）、交易区、仓储物流区、信息区、配套服务区。二期项目建设交易区、仓储区和物流运输区、配套服务功能完善。三期为预留用地。